U sklopu Unije studenata kao ogranci po fakultetima djeluju Asocijacije studenata. Asocijacije studenata formirane su za svaki fakultet, za većinu Univerzitetskih studija te za Studnetski centar.
Asocijacija studenata u okviru svojih nadležnosti ima sljedeće ciljeve:
• rad na moralnom, intelektualnom, kulturnom, naučnom uzdizanju studenata Fakulteta,
• utvrđivanje i širenje svijesti po potrebama tehnološke obrazovanosti,
• organizacija studenata u cilju njihovog jačanja svijesti o sopstvenoj vrijednosti i o sebi kao glavnoj potencijalnoj vrijednosti Bosne i Hercegovine,
• podržavanje i zaštita interesa članova koji proističu iz njihovog statusa studenta,
• rad na izgradnji odgovarajućeg socijalnog i materijalnog statusa studenata,
• rad na unapređenju nastavnog procesa,
• saradnja sa bivšim i novim studentima i studentskim organizacijama u interesu Asocijacije,
• organizovanje tribina, javnih rasprava, seminara, simpozija i drugih kulturnih manifestacija,
• rad na promovisanju svog Fakulteta u Domovini i inostranstvu,
• rad na promovisanju Mostara i države Bosne i Hercegovine,
• uspostava međunarnodne saradnje sa srodnim institucijama,
• rad na unapređenju saradnje između vodstva Fakulteta i studenata.
Asocijacije studenata pri Uniji studenata:
• Asocijacija studenata Mašinskog fakulteta (AS MFMO)
• Asocijacija studenata Građevinskog fakulteta (AS GFMO)
• Asocijacija studenata Fakulteta informacijskih tehnologija (AS FIT)
• Asocijacija studenata Pravnog fakulteta (AS PFMO)
• Asocijacija studenata Nastavničkog fakulteta (AS NFMO)
• Asocijacija studenata Fakulteta humanističkih nauka (AS FHN)
• Asocijacija studenata Ekonomskog fakulteta (AS EFMO)
• Asocijacija studenata Agromediteranskog fakulteta (AS AFMO)
• Asocijacija studenata Univerzitetskog strudija zdravstvene njege
• Asocijacija studenata Studentskog centra (ASSC MOSTAR)